前总统陈水扁在保外就医期间接受日本《产经新闻》採访，主张台湾应举行公投独立，台北市长柯文哲今赴议会总质询，被问及这种谈话对台湾好吗？他叹气说，相信蔡英文总统跟他一样头痛，不过“民进党应勇敢处理阿扁问题。”
《中时电子报》报道，国民党议员王欣仪今质询指出，阿扁不断游走司法边缘，日前还接受日本媒体访问主张要用台独公投对抗大陆打压，在保外就医期间，这样的谈话对台湾好吗，对其他受刑人公平吗？
柯文哲表示，他已经被阿扁医疗小组开除了，接着欲言又止说，这实在是….，其实它就是一个问题，蔡总统要面对这个问题，这样摆着也不是办法。他也认为阿扁在保外就医身分下，应该不要这样讲。
王欣仪追问，如果柯是总统会怎么做？柯文哲听闻直说，没有没有，这不能讲，强调蔡总统应该跟他一样头痛，不过民进党应勇敢处理阿扁问题，他们要好好沟通。
另外，王欣仪提到，蔡总统3日参加秋祭忠烈祠殉职人员典礼，不仅不唱国歌，还疑似有吐口水的不敬行为，这样配当总统吗？柯文哲尴尬说，不一定要唱（国歌）啦，也没有说大家要一起唱，“反正我是有唱啦。”至于外界质疑蔡总统吐口水，他则认为不要过度解读。
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