中国大陆称交通运输部星期六（6月6日）组织开展台湾东部海域海上交通专项执法，并指这是针对日本和菲律宾海域划界谈判“严重侵犯中国领土主权和海洋权益”的必要行动。
中国官媒新华社星期六晚公布，中国交通运输部组织福建海事局、广东海事局、东海航海保障中心、东海救助局，开展台湾岛东部海域海上交通专项执法行动，“全面履行我国（中国）海上行政执法管辖权，增强深远海巡航执法和重点水域交通管控能力，保障海上交通安全，维护国家权益”。
新华社补充称：“这是针对日本和菲律宾单方面宣布启动中国台湾岛以东海域划界谈判、严重侵犯中国领土主权和海洋权益采取的必要行动。”
日本与菲律宾5月28日启动“专属经济区（EEZ）及大陆礁层海洋边界谈判”，范围和台湾东部海域重叠。台湾外交部5月31日发新闻稿予以“肯定”，期待三方共同对区域和平稳定及维护海洋生态做出具体贡献。台湾外交部后于星期三（6月3日）呼吁日菲应考量台湾权益，并就相关议题与台湾进行协商。
台湾政府的大陆委员会副主委沈有忠星期六说，日菲两国是在“全面战略伙伴关系”框架下协商专属经济海域划界问题，而台湾与日本、菲律宾之间均已签有协议，因此台湾的主权与渔业权益绝不会受到影响；真正值得警惕的是北京借相关议题扩大海警执法范围，并持续通过军机军舰扰台施压台湾。
此前，中国大陆海警岱山舰编队星期一（6月1日）已在台湾岛以东海域开展执法巡查，当时给出的理由与本次海上交通专项执法如出一辙。
中国大陆外交部发言人毛宁星期二（6月2日）回应称，根据《联合国海洋法公约》，海岸相向或相邻国家间的专属经济区和大陆架界限，应由有关国家本着公平原则以协议划定，“涉及台湾以东海域划界谈判必须有中方参与”。
中国大陆国台办发言人朱凤莲星期三则在例行记者会说：“世界上只有一个中国，台湾是中国的一部分。日本、菲律宾宣布的拟划界海域位于中国台湾岛以东，其所谓‘划界谈判’严重侵害中国海洋权益，严重违反国际法和国际关系基本准则，完全非法无效。”
据日本放送协会（NHK）报道，关于与菲律宾的谈判，日本政府曾表示：“如果双方达成协议，划界协议将明确日本和菲律宾这两个相关方的权利和义务，不对第三方产生法律约束力，在国际法方面也不存在任何问题。”
