医学校友会对推动马来亚大学的成立，发挥了重要作用。
吴安全指出，校友会首届会长陈树楠医生，以及被称为“新加坡病理学之父”的尚穆加那特纳姆（Kanagaratnam Shanmugaratnam）医生（总统尚达曼的父亲）等杰出校友，是倡议殖民地政府成立新马第一所大学的其中重要推手。爱德华七世医学院与前莱佛士学院（Raffles College）在1949年合并，成立马来亚大学。
此外，校友会早年也定期举办临床和病理学会议和出版期刊，推动医疗工作者不断学习和提升专业水平。直到新加坡医药协会（Singapore Medical Association）在1959年成立，肩负起与政府接洽及各项专业功能后，校友会才成为一个主要联系校友与医疗社群的组织。
