来自杜克—新加坡国立大学医学院的科学家,研发出两款先进计算工具,日后可让研究人员更好地理解人体内的细胞之间如何“交流对话”。这有望加速癌症、神经退行性疾病和精准医疗方面的研究突破。

杜克—国大医学院日前发文告公布最新研究成果,并介绍两款新工具——数据模拟器sCCIgen,以及真实数据分析器QuadST。

文告指出,人体内的每一个细胞,不断在发送和接收信号,帮助身体生长、保持健康并抵御威胁。一旦这些细胞间的“对话”出现差错,疾病往往就会随之发生。

以阿尔茨海默症(Alzheimer’s disease)为例,神经细胞之间的信息传递失常,会影响记忆和思考能力;在癌症中,癌细胞可能通过发出错误信号,“误导”免疫系统,使身体无法识别并清除它们。

理解这些复杂的细胞交流,是生物医学研究的关键,但传统研究方法往往难以完整捕捉这种高度复杂的互动过程。

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因此,以杜克—国大医学院定量医学中心(Centre for Quantitative Medicine)宋晓禹副教授为首的研究团队,研发这两个新工具。第一款工具sCCIgen是一款模拟器,可创建“虚拟组织”(virtual tissues),显示细胞的位置,以及相关基因的活跃情况。

宋晓禹形容,就像飞行员使用飞行模拟器练习,sCCIgen就像一个“实践实验室”,为科学家提供一个可控环境,用于测试他们的计算工具,是否真的能检测到细胞之间的“交流”。

“这有助于加速癌症、免疫学和神经科学领域的发现。”

第二款工具QuadST用来分析真实的组织数据,协助研究人员找出哪些基因和细胞类型正在相互“交流”。

当研究团队将QuadST应用于脑组织分析时,发现数百个在神经细胞交流过程中出现明显变化的基因,其中许多与神经突触(synapses)有关。这些发现,有助科学家更好理解癫痫和神经退行性疾病等病症中,神经细胞发生变化的机制。

QuadST也可以应用于肿瘤研究,例如分析癌细胞如何与免疫细胞互动,以及为何部分患者对治疗的反应更佳。

研究团队接下来计划扩展sCCIgen功能,以模拟蛋白质及其他分子之间的相互作用,并利用QuadST建立一个记录细胞间交流相关基因的参考数据库。这个数据库可帮助科学家比较不同组织和疾病的研究结果,加快新发现的步伐,并为研发更精准的治疗方法提供支持。