癌症治疗的效果,除了取决于药物和患者身体条件,还与特定微生物“选边站”息息相关。本地科学家研究出一部从癌细胞中获取微生物的操作指南,让这项堪称“大海捞针”的任务有章可循。
新加坡国立大学杨潞龄医学院星期三(3月25日)发文告宣布,医学院和新加坡科技研究局属下新加坡基因组研究院带领一个国际团队,研究出从癌细胞中获取微生物的规范做法,相关论文已于上月在国际学术期刊《自然癌症》(Nature Cancer)上发表。
项目其中一位主要负责人是国大杨潞龄医学院感染科转化研究项目生物化学系副教授纳塔拉詹(Niranjan Nagarajan),他也是新科研基因组研究院计算与人工智能副主任。他说:“要从肿瘤细胞中找到微生物的遗传物质DNA,好比大海捞针。”
微生物一般指细菌、真菌、病毒等肉眼看不到的生物,往往比癌细胞还小得多,但可能对癌细胞的生长和抗癌药物的疗效起关键作用。
譬如,有的微生物“站在癌细胞一边”,可以让癌细胞更活跃,有的则在癌细胞的“对立面”,可以抑制癌细胞的生长;不少抗癌药物也需要某些微生物的配合,才能发挥最佳疗效。
科学家把在特定环境中的微生物称为微生物组(microbiome),通过了解不同微生物的基因特性,研究它们的个别功能。然而,微生物在人体不同器官肿瘤组织中的含量往往极其微小,甚至缺失,且非常容易受到污染,使采集、储存及研究微生物的过程困难重重。
通过对比和分析现有研究 总结出一份最佳实践清单
纳塔拉詹告诉《联合早报》记者,11位来自新加坡、美国、荷兰、丹麦、澳大利亚等地的科学家花了一年时间,通过对比和分析现有微生物研究结果,总结出一份可为实际操作提供参考的最佳实践清单。
清单分为七大类,涉及微生物样本采集阶段时预防污染、处理与储存样本的规范流程、实验室分析策略,以及确保研究报告透明度等不同方面的具体操作事项。
纳塔拉詹解释说:“倘若在分析流程中没有适当的把关和特别验证,就很难从干扰信息中获取真正有价值的微生物信号。”
研究团队希望这份操作清单可为癌症生物学进一步提供重要线索,并为诊断和治疗癌症带来启发。
