对于外界盛传他将接任民进党主席，会否受论文案影响，桃园市长郑文灿星期一（12月5日）出席活动受访时称，民进党会有智慧推出适合的党主席。
综合台湾《联合报》和中时新闻网等报道，台湾大学上周认定郑文灿在国发所撰写的论文涉抄袭，后决定撤销他的硕士学位。针对此决定会否影响他接任民进党主席，郑文灿5日主持桃园市府出版“观塘·塘观”寻访千塘之乡的桃花源记新书发表会接受媒体联访时，作出上述回应。
他说，民进党党务的调整，还是要形成党内的多数看法，他会抱着这样的态度面对党务改组。
他认为，民进党会有智慧推出党主席迎接总统大选跟立委选举，这点请大家不用担心。
至于他的硕士论文将被台湾图书馆下架，郑文灿说，台大社科院学伦会用现在严谨的学术标准检视过去的论文，基于对台大的尊重、爱护，他会坦然接受；虽然有遗憾，不过未来应该建立起一套对这些问题处理的标准，台大学伦会的审议，是可以从道歉、修改论文到撤销，不同层级的做法，这个未来应该有建立制度的空间。
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