英国剑桥大学领衔的研究团队近日宣布,他们开发出一种名为“phylowave”的分析工具,能追踪病原体家谱中种群组成的动态变化,自动识别具高危险性新变种,从而提高变种鉴定效率和准确性,帮助公共卫生机构及时作出回应。

新华社报道,这个分析工具能根据病原体不同变种的亲缘关系,绘制系统发生树(Phylogenetic Tree),记录不同基因型之间的进化关系。研究团队在《自然》杂志上发表的论文中指出,phylowave能通过分析受感染人群的病原体样本,量化各变种的适应环境能力,并自动识别适应性和传播力较强的新变种。

这个工具已在对甲型H3N2流感病毒、百日咳杆菌(Bordetella pertussis)和结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)等病原体的分析中得到验证。研究发现,新的分析工具不仅能识别已知的主要变种,还能发现一些此前未知的、适应性较强的变种。

细菌和病毒的进化速度极快,可随时出现传播力更强、更擅长逃避免疫系统攻击或能对抗疫苗和药物作用的新变种。及时识别这些变种及其适应性优势,是应对传染病挑战的关键。

传统基因分析方法在新变种鉴定效率和精度上存在不足,且确认新变种往往依赖专家团队讨论,带有一定主观性。与之相比,phylowave在效率和客观性上更具优势,对病原体样本的要求也更低,即便样本数量较少或抽样存在偏差,依然能有效分析。

延伸阅读

中国科学家运用AI算法发现大量RNA病毒
世卫组织确定17种病原体开发新疫苗 重点关注低收入国家
世卫组织确定17种病原体开发新疫苗 重点关注低收入国家